カルソネラ・ルディアイ
Candidatus Carsonella ruddiiは、細胞内共生のガンマプロテオバクテリアである。既知の細菌の中で最も小さいゲノムを持っています。
本種は、サイロイドと呼ばれる葉茎の樹液を食べる昆虫の全種に存在する内共生体である。この内共生体は、バクテリオームと呼ばれる特殊な構造体の中で発生する。
2006年、日本の理化学研究所とアリゾナ大学で、Ca.C.ruddiの1株のゲノムが解読された。C. ruddiの1株のゲノム配列が日本の理化学研究所とアリゾナ大学で決定された。ゲノムは159,662塩基対の円形染色体で、高いコーディング密度（97％）を持ち、重複する遺伝子が多く、遺伝子の長さは短くなっていた。予測される遺伝子の数は182で、これも過去最低であった（NCBI-Genome）。生命に必須とされる数多くの遺伝子が欠落しているようで、オルガネラ的な状態を獲得している可能性が示唆されている。
これに対し、自由生物の中で最も小さなゲノムを持つマイコプラズマ・ジェニタリウムは、521個の遺伝子を持つ。
質問と回答
Q:Candidatus Carsonella ruddiiとは何ですか?
A: Candidatus Carsonella ruddiiは、葉茎を食べる昆虫であるキジラミの全種に存在する内共生型のガンマプロテオバクテリウムである。
Q: Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムの大きさはどのくらいですか?
A: Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムは、159,662塩基対の円形染色体で、バクテリアの中で最も小さいものである。
Q: Candidatus Carsonella ruddiiに存在すると予測される遺伝子はいくつですか?
A: Carsonella ruddiiの予測遺伝子数は182個で、過去最少である（NCBI-Genome)。
Q: Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムのコード密度はどのくらいですか?
A: Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムは97%という高いコーディング密度を有しています。
Q: バクテリオームとは何ですか?
A: バクテリオームとは、Candidatus Carsonella ruddiiの内部で共生している特殊な構造です。
Q: Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムに欠けているものは何ですか?
A:Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムには、生命維持に必要な多くの遺伝子が欠落しており、オルガネラのような状態になった可能性があると考えられています。
Q: Candidatus Carsonella ruddiiのゲノムは、Mycoplasma genitaliumのゲノムと比較してどうでしょうか?
A: 自由生物で最も小さなゲノムを持つマイコプラズマ・ジェニタリウムのゲノムは521個であり、Candidatus Carsonella ruddiiの予測遺伝子数より大幅に多い。
