ムハンマド・アリ・ジンナーは、1876年12月25日にカラチでイスマーイール派のプーンジャ・ジンナーの家に生まれた。ジンナーシンド州シティーのジヒルクで生まれた。父の名はジンナー・プーンジャ（1857-1901）、母の名はミティバイである。ジンナーは、ジンナー・プーンジャとミティバイの7人の子供の長男であった。彼の家族は、インドのグジャラート州のカティアワール地方からシンド州に移住してきた。
ジンナーの出生時の名前はマホメダリ・ジンナーバイである。家庭では、家族はグジャラート語で話し、子供たちはクトチ語と英語も話すようになった。ファティマ以外の兄弟姉妹はほとんど知られていない。
社会人初期
1891年（15歳）、ジンナーはロンドンに渡り、ある会社で数年間働いた。その頃、彼の母親が亡くなった。
1894年、ジンナは会社を辞めて法律を勉強した。1894年、ジナーは仕事を辞めて法律を学ぶためにリンカーンズ・インに入学し、1896年に卒業した。ロンドンでは、政治活動にも参加するようになった。彼は、インドの政治家ダダバイ・ナオロジやサー・フェローゼシャー・ミータを非常に尊敬していた。ジンナーは、次第に自分なりの政治観を持つようになっていた。彼は、インドが立憲的な自治を持つべきという路線で考えていた。
この頃、父親が事業に失敗した。このため、ジンナーは大きな困難に直面した。一方、彼はムンバイで弁護士として活動を始めていた。そして、ムンバイのマラバー・ヒル地区に家を建てた。この家は、現在、ジンナーハウスとして知られている。
弁護士として成功した。1908年、彼はインド国民会議の有名な指導者であるバル・ガンガーダル・ティラクの弁護を担当した。ティラクは、イギリス支配に対する扇動罪で起訴されていた。ジンナーはうまく弁明したが、ティラクは刑務所に送られ、それ以来、彼は希望を失っていた。
政治家としての初期
ジンナーは、政治を始めた1906年には、すでにインド国民会議に参加していた。国民会議はインドで最大の政治組織であった。インド国民会議のメンバーや指導者の多くは、インドの限定的な自治を支持していた。ジンナーもまた同じ考えを持っていた。当時、彼が手本としたのはゴパール・クリシュナ・ゴカレであった。
1910年1月25日、ジンナーは72名のメンバーからなる帝国議会議員に就任した。1910年1月25日、ジンナーは72名の帝国議会議員に就任した。第一次世界大戦中、ジンナーは他の多くのインド指導者と同様、イギリスを支持していた。
ジンナーは当初、インドのもう一つの政治組織である全インド・ムスリム連盟への加盟を避けていた。ムスリムは1906年に同連盟を結成していた。1913年、ジンナーはムスリム同盟の一員となった。1934年、彼はムスリム同盟の会長に就任した。彼は議会とムスリム同盟の間の協定（1916年のラクナウ協定）の締結に貢献した。この協定は、インドに大英帝国の自治領としての地位を与えるために、イギリスに対して統一戦線を張ろうとするものであった。これは、当時カナダ、ニュージーランド、オーストラリアが持っていた支配的地位と同様のものであった。
1918年、ジンナは再婚した。2番目の妻はラッタンバイ・プティ。24歳年下である。彼女はジンナーの個人的な友人であるディンシャー・プティ卿の娘で、パールシー教徒であったが、ラッタンバイはジンナーと結婚する前にイスラム教を受け入れ、名前をマリアムと改名していた。夫妻はボンベイ（現在のムンバイ）に住み、しばしばヨーロッパに旅行した。1919年、妻は娘を出産し、ディナと名付けられた。
1918年、モハンダス・ガンディーは、会議派のリーダーのひとりになっていた。ガンジーは、インドの自治を獲得するために非暴力による抗議を行う路線をとりました。ジンナーはそれとは異なる路線をとった。彼はインドの自治を獲得するために憲法闘争を望んでいました。ジンナーもまた、ガンディーのヒラファト運動への支持に反対した。このように、二人の間には次第に多くの相違が生じるようになった。1920年、ジンナーは会議派を離党した。彼はムスリム同盟の会長になった。このときジンナーは、会議派とムスリム同盟の間の相違を解消するためのプログラムを持ち出した。そのプログラムは14の行動ポイントから成っていた。したがって、それはジンナーの14項目として一般に知られるようになった。しかし、会議派はこれを受け入れなかった。
この間、ジンナーの私生活は苦しくなっていた。1927年に夫婦は別居し、ラッタンバイは重病の末に亡くなった。
その頃、インド人指導者とイギリス政府との会議があった。ロンドンで開催され、円卓会議と呼ばれるものだ。ジンナーはガンジーの政策を批判した。この会議は失敗に終わった。ジンナーはムスリム同盟にも不満を持っていた。彼は、政治をやめることにした。そして、再びイギリスで弁護士として働き始めた。この間、妹のファティマはジンナーの公私にわたる世話をしていた。妹のファティマは、ジンナの公私にわたる世話をしていた。ジンナの娘、ディナ・ワディアの子育てにも協力した。娘はパラシー教徒でキリスト教に改宗したネヴィル・ワディアと結婚した。ジンナーはこの結婚を好まなかった。
イスラム教徒連盟の指導者
アガ・カーン3世、クーダリー・ラフマット・アリー、ムハンマド・イクバルなど、インドの多くのイスラム教指導者がジンナーにインドに戻るよう要請した。
ムスリム同盟の指導者たちは、彼にムスリム同盟の指揮をとってもらうことを望んでいた。ジンナーはインドに戻ることに同意した。1934年、彼はロンドンを離れてインドに戻り、ムスリム リーグを再び再編成した。しかし、1937年の選挙でムスリム同盟はわずかな議席しか獲得できず、彼は党の威信を復活させることができなかった。しかしこのとき、同盟はパンジャブ州の有力な首相であるシカンダル・ハヤト・ハーン卿に助けられていた。1937年10月、彼はジンナーのムスリム同盟が彼の強力な政権に参加することに同意した。これはジンナー＝シカンダール協定と呼ばれるものであった。
会議派との対立はさらに大きくなり続けた。1930年、アラマ・イクバルのようなイスラム教指導者たちは、インドのイスラム教徒のために独立した国を作るべきだと主張していた。彼はついに、ヒンズー教徒とイスラム教徒は一つの国には住めないという結論に達した。ジンナーもまた、インドのムスリムたちのために独立した国を作るという考えを持ち始めた。ジンナーとムスリム同盟は、そのような独立国を得るための活動を開始した。彼らは、1940年にパキスタン決議と呼ばれる計画を立てました。この新しい国はパキスタンと名づけられることになりました。
1941年、ジンナーは「ドーン」という新聞を創刊した。この新聞は、ムスリム同盟の見解と政治的思考を掲載した。第二次世界大戦中、ジンナーはイギリスを支持し、議会党のインド停戦運動に反対した。1944年、ガンジーはジンナーと14回にわたる会談を行ったが、結論は出なかった。この頃、ムスリム同盟はいくつかの州で政府を樹立し、中央政府にも進出していた。
パキスタンの創始者
第二次世界大戦後、イギリスはインドを独立させるために動き出した。1946年5月16日、イギリスはインド統一計画を発表しました。その1ヵ月後の1946年6月16日、イギリスはイギリス領をヒンズー教徒とイスラム教徒のための2つの国に分割する別の計画を発表しました。
会議派は、1946年5月16日の計画を受け入れた。ジンナの指導するムスリム連盟は 両方の計画を受け入れましたしかし、1946年8月16日、ジンナーは、旧英国領のムスリムによる独立国であるパキスタンの独立を達成するための直接行動も発表した。何度かの議論の末、英国統治時代は（1947年8月に）インドとパキスタンの2つの国に分割された。1971年、バングラデシュがパキスタンから独立した。
総督
イギリス領インドが、インドとパキスタンに分割された。ジンナーはパキスタンの初代総督となり、妹のファティマ・ジンナーは「国母」となった。彼はまた、パキスタンの選挙区議会の議長にもなった。1947年8月11日、ジンナーは選挙区議会での演説で、世俗的な国家としてのパキスタンの将来について述べました。彼はこれを次のような言葉で語っている。
どんな宗教、カースト、信条に属していても、それは国家の仕事とは関係がない。いずれヒンズー教徒はヒンズー教徒でなくなり、イスラム教徒はイスラム教徒でなくなるでしょう。宗教的な意味ではなく、それは各個人の信仰ですから。
ジンナーもまた、政府を直接指揮するようになった。分割後、イスラム教徒とヒンズー教徒の間で大規模な暴力が起こった。パンジャブ州やベンガル州では、そのような暴力が深刻であった。ジンナーは、インドのヒンドゥー教指導者たちとともにその地域を回り、住民を鎮めることに努めた。この暴力で多くの人が死んだ。死者数は、20万人から100万人以上とさまざまだ。ジンナーは、個人的にこれらの出来事にとても悲しんでいた。
インドとパキスタンが独立した直後、カシミール地方で武力衝突が起こった。カシミール地方の王はインドの一部になることに同意していましたが、カシミール地方のほとんどのイスラム教徒はこれを好まないのです。彼らはカシミール地方で戦いを始めました。インドは軍隊をインドの一部となったカシミール地方に送らなければなりませんでした。インドはこの問題を国連に提起しました。国連は、紛争を終わらせ、国民投票を行うよう命じました。この問題は、いまだにインドとパキスタンの関係に悪い影響を与え続けています。
ジンナーは、新しい国家としてのパキスタンの創設に非常に重要な役割を果たしました。そのため、彼はパキスタンの人々の間で非常に人気がありました。東パキスタン（現バングラデシュ）では、ウルドゥー語を唯一の国語とするジンナーの考え方に人々が反対しました。
