相補性(DNA・RNA):塩基対と相補鎖の定義と仕組み

相補性(DNA・RNA)の定義と仕組みを図解でわかりやすく解説:塩基対と相補鎖の原理、複製での役割を初心者向けに詳述。

著者: Leandro Alegsa

分子生物学において、相補性とは、DNARNAなどの核酸が示す特性(どの塩基同士が結合できるか)を指します。各ヌクレオチドには窒素塩基があり、それぞれの窒素塩基は特定の他の塩基と対を作ることができます。塩基どうしが塩基対が水素結合で非共有結合しているという点が、相補性の本質です。

相補性の基本的なルール

一般に、塩基の相補関係は次のように定義されます。

  • AT と相補的(DNAでの標準的対) — A–T 間は水素結合2本。
  • CG と相補的(両者は水素結合3本でより強固)。
  • 一方、RNAでは T の代わりに U(ウラシル)が入り、A–U が相補的(A–U は通常水素結合2本)。

この「1対1の対応」があるため、一本鎖から正確な相補鎖を作ることが可能になります。

鎖の向き(5' と 3')と相補鎖の表記

二本鎖DNAでは、二本の鎖は互いに逆向き(アンチパラレル)に並びます。塩基配列を示すときは向きを明記することが重要です。例えば、次のような例を考えます。

元の鎖(5'→3'): A G T C A T G

この鎖に対する相補鎖は

  • 相補塩基を並べたもの(元の鎖と逆向きに書いた場合、3'→5'): T C A G T A C
  • 相補鎖を5'→3'の向きで表記した(実際に配列を記す場合)と: C A T G A C T(これを「リバースコンプリメント(逆相補鎖)」と呼ぶこともあります)

つまり、相補鎖を示すときは「どちらの端を先に読むか(5'側か3'側か)」を明確にする必要があります。

DNAとRNAでの違い、例外やバリエーション

  • RNA特有の置換:RNAではチミン(T)の代わりにウラシル(U)が現れ、A–U が基本的な相補対になります。
  • ワブル(Wobble)対:RNAの二次構造や翻訳時には、G–U の「ワブル」対のような非標準的な対形成がよく見られます。これは完全なワトソン=クリック対ではありませんが機能的に重要です。
  • 非ワトソン=クリック対: Hoogsteen 配列や他の非標準的結合様式も存在し、配列・修飾・環境によって相補性の振る舞いは変わります。
  • 塩基の不一致と修復:時に誤った塩基対(ミスマッチ)が生じますが、多くの生物は校正酵素や修復機構でこれを訂正し、突然変異を抑えています。

生物学的意義と応用

  • 酵素は1本鎖の鋳型から相補鎖を合成できます。これはDNAの複製だけでなく、転写(DNA→mRNA)や逆転写(RNA→DNA)にも重要です。
  • 相補性は遺伝情報の正確な複製と伝達を可能にし、翻訳や遺伝子発現制御、RNAの二次構造形成にも影響します。
  • 実験技術でも利用されます(例:PCRプライマー設計、ハイブリダイゼーションプローブ、シークエンシング、CRISPRガイドRNAの設計など)。

簡単なまとめと例

・相補性は塩基間の特異的な結合(主に水素結合)に基づく。A–T(DNA)、A–U(RNA)、C–G が基本。C–G は A–T よりも安定。
・鎖はアンチパラレル(逆向き)であることに注意。配列を扱うときは5'・3'の向きを明確にする。

先の例をまとめると:

元の鎖(5'→3'): A G T C A T G

相補鎖(3'→5'): T C A G T A C

相補鎖を5'→3'で表記(逆相補鎖): C A T G A C T

左はDNAを構成するヌクレオチドとその相補的な塩基対。AとTの間には2つの水素結合があり、CとGの間には3つの水素結合がある。右側はDNAの配列Zoom
左はDNAを構成するヌクレオチドとその相補的な塩基対。AとTの間には2つの水素結合があり、CとGの間には3つの水素結合がある。右側はDNAの配列

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質問と回答

Q: 分子生物学における相補性とは何ですか?


A: 相補性とは、分子生物学において、DNAやRNAなどの核酸が持つ性質で、各ヌクレオチドには、別の異なるヌクレオチドの窒素塩基と対になりうる窒素塩基があります。

Q: 窒素塩基はどのように互いに相補的なのですか?


A: それぞれの窒素塩基は、別の異なるヌクレオチドの窒素塩基と対になることができ、これらの塩基対は水素結合によって非共有結合で結ばれています。

Q: 相補性がDNA複製に重要なのはなぜですか?


A: 酵素は任意の一本鎖から相補鎖を作ることができ、これがDNA複製に必要なのです。

Q: DNAとRNAに見られる塩基の相補的な対は何ですか?


A: DNAとRNAの塩基の相補的な対は、AとT、CとGです。

Q: どの窒素塩基も他の窒素塩基と対になることができますか?


A: いいえ、DNAとRNAのどの塩基も相補的な塩基は1つだけです。

Q: DNAの塩基配列A G T C A T Gの相補鎖の窒素塩基配列はどうなっていますか?


A: DNA配列A G T C A T Gの相補鎖の窒素塩基配列は、T C A G T A Cとなります。

Q: DNAとRNAの塩基の相補対はどのように結合しているのか?


A: DNAとRNAの塩基の相補対は、水素結合によって結合しています。


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