Hugo Gene Nomenclature Committee (HGNC)

HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC)は、既知のヒト遺伝子に対して、ユニークで意味のある名前を設定します。専門家に意見を求めます。HGNCは、すべての遺伝子に長い名前と略語（記号と呼ばれる）をつけている。HGNCはHuman Genome Organisation（HUGO）の一部です。

従来の遺伝子名や略語は、一つの遺伝子に特化したものではないことが多い。例。CAP（単に「染色体関連タンパク質」という意味）は、6つの異なる遺伝子のいずれかを指すことがあります。(BRD4、CAP1、LNPEP、PTPLA、SERPINB6、SORBS1）。

CAPのような従来の名称とは異なり、HGNCの短い遺伝子名（遺伝子記号）は、1つの遺伝子にのみ与えられます。そのため、どの遺伝子を指しているのかという混乱が少なくなります。

ネーミングガイドライン

HGNCでは、遺伝子の命名とシンボル（遺伝子名の略語）の割り当てを行っています。

遺伝子記号は一意でなければならない
記号は、ローマ字とアラビア数字のみを使用します。
記号は、句読点やGeneの "G "を含んではならない。
記号は、コード化されている種への言及を含まないものとします。例えば、「H/h」はヒューマン

HGNCの命名法ガイドラインの完全な説明は、彼らのウェブサイト[2]に掲載されています。HGNCでは、異なるスプライスバリアントを区別するために_v1, _v2,...という付録を提唱しており、単一の遺伝子のプロモーターバリアントについては_pr1, _pr2,...としている。

また、HGNCでは、「遺伝子命名法は、歴史的なものや単一の遺伝子命名法が適用された場合に起こるような制限的なものではなく、新しい技術に合わせて進化すべきである」としている。

手順

HGNCは、問題となっているヒト遺伝子について発表した著者に電子メールで連絡を取る。その際、提案された命名法についての意見を求められる。また、HGNCは他のデータベースキュレーターや、特定の遺伝子ファミリーや遺伝子セットの専門家と協力している。

リビジョン

標準化された遺伝子名が確立された後に変更すると、混乱を招く恐れがあります。そのため、そのような変更の是非については議論の余地がある。このような理由から、HGNCは、その遺伝子を研究しているほとんどの研究者からの同意が得られた場合にのみ、遺伝子名を変更する。

質問と回答

Q: HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC)はどのような役割を担っているのですか?

A: HGNCは、既知のすべてのヒト遺伝子に対して、ユニークで意味のある名前を設定します。

Q: HGNCはどのようにして遺伝子の名前を決めているのですか?

A: HGNCは、すべての遺伝子に長い名前と略称をつける前に、専門家の意見を聞いています。

Q: HGNCが各遺伝子に付けた名前の略称は何ですか?

A: 略号はシンボルと呼ばれています。

Q: 従来の遺伝子名や略号は、なぜ1つの遺伝子に特化していないのですか?

A: 従来の遺伝子名や略号は、複数の異なる遺伝子を指すために使用されることがあり、混乱を招きます。

Q: HGNCでは各遺伝子にいくつの遺伝子記号が与えられているのですか?

A: HGNCの短い遺伝子名、すなわち遺伝子記号は、1つの遺伝子にのみ与えられています。

Q: 従来の遺伝子名の代わりにHGNCの遺伝子記号を使用するメリットは何ですか?

A: HGNC遺伝子記号を使用することで、どの遺伝子を指しているのかの混乱を減らすことができます。

Q: HGNCはどのような団体に属していますか?

A: HGNCはHuman Genome Organisation (HUGO)の一部です。