うずまきナルト
チーム7のメンバーであり、九尾の蔵馬のジンチャリキーでもある同名の主人公は、村人から尊敬され、皆を守るために火影になる野望を持っている。シリーズを通して、大筒木阿修羅の子孫であり、そのチャクラとスタミナを受け継いだことが明らかになったナルトは、多くの外国人やコノハの人々と親交を深め、彼らの人生に大きなプラスの影響を与え、世界的な名声を得るまでになる。やがてナルトは火影になるという夢を叶え、日向ヒナタとの間に子供のBORUTOとHIMAWARIをもうける。
サスケ・ウチハ
チーム7のメンバーであり、シェアリング・アイで知られるインドラ・オツツキの子孫であるウチハ一族の生き残りである主人公。サスケは一族の仇を討つことを唯一の目的としているが、第四次世界大戦までの真実を知ると、最終的には隠し葉に反旗を翻すことになる。BORUTO」で腕を失ったサスケは、「木ノ葉隠れ」に協力しながら、大筒木一族の世間への影響を調査する放浪の自警団となった。
春野さくら
ナルトの友人の一人で、7班の女性隊員。当初はサスケに心酔していたが、ナルトには反感を抱いていた。しかし、次第にサスケを友人として見るようになり、やがてサスケと結婚して娘のサラダを育てるようになる。
カカシ・ハタケ
チーム7/チームカカシのリーダー兼先生。以前はナルトの父ミナトの教え子で、チームメイトのオビト・ウチハからシャリガンを手に入れていた。第四次大戦後、カカシは六代目火影となり、長年にわたってコノハを統治してきたが、ナルトのために退位した。
サイ
第二部でサスケの代わりにチーム・カカシに参加した忍者で、描いた絵に命を吹き込むことができる。当初、財団の監督である志村ダンゾウに感情を持たない人間として育てられていたが、ナルトやサクラと心を通わせることで社会性を身につけていく。シリーズのエピローグでは、サイは山中家に嫁ぎ、妻のいのと一緒に息子のいのじんを育てることになる。
ヤマト
チーム・カカシの副リーダーとなるANBU隊員で、子供の頃に柱間の木刀を再現するために小呂智丸に実験された結果、元の姿を失ったという。柱間の細胞を持っているため、ナルトが尾獣のチャクラに飲み込まれそうになると、九尾を制圧するのに欠かせない存在となっている。
ヒドゥンリーフビレッジ
海野 イルカ
幼い頃、蔵馬に両親を奪われた忍者アカデミーの教官。そのため、三代目火影の判断にもかかわらず、同じ境遇のナルトの先生になることに気が引けていた。イルカはナルトを初めて認めた人物であり、ナルトにとって父親のような存在である。
コノハマル・サルトビ
三代目火影の孫で、ナルトを師と仰ぎ、仕事熱心で決断力があり、ラセンガンやセクシー・ジツなどの得意技を持っている。しかし木ノ葉丸は、ナルトが火影になってから自分も火影になると言い張る。シリーズのエピローグでは、木ノ葉丸は上忍に昇格し、ナルトの息子・ボルートの師匠となっている。
日向ひなた
ナルトの友人であり、白眼の持ち主として知られる羽村大筒木の子孫である日向一族の一人。本家の長女だったが、内気で自分の意思を貫けないため、父・日出に勘当され、妹の花火と入れ替わっていた。その後、ヒナタはクレナイ・ユウヒに預けられ、犬坂キバや阿波レイメ・シノとともにチーム8の玄人教育を受けることになった。また、ナルトの決意に感銘を受けたヒナタは、自分に自信を持つようになり、ついにナルトに愛を告白する。ヒナタはナルトと結婚し、シリーズのエピローグまでに2人の子供を授かる。
チームあすか
三代目火影の息子である猿飛アサマと、その弟子である奈良シカマル、サクラのライバルである山中いの、秋道チョウジの3人で構成されたチーム10。シカマルたちは、現在の「伊能・シカ・チョウ」の呼称を受け継ぐ一族でもあり、密接な関係にある。第2部では、アカツキのメンバーであるヒダンにアスマが殺され、シカマルがその仇を討ち、アカツキのリーダーとなる。シリーズのエピローグでは、阿修羅の娘・猿飛未来の世話をするという約束を守り、シカマルたちはそれぞれ結婚して、奈良シカダイ、秋道チョウチョウ、山中イノジンを次の「猪鹿町」として育てている。
チーム・ガイ
カカシのライバルであるマイト・ガイと、彼の弟子であるロック・リー、日向のいとこであるネジャ・ヒュウガ、テンテンの3人からなる忍者チーム。中忍になるための試験を受ける前に、ガイが1年待つことを望んだため、他の隠し砦の玄人たちよりも1歳年上である。シリーズ終盤では、ナルトとヒナタを救うためにネジは自らを犠牲にし、ガイは究極の攻撃を受けて致命的なダメージを受け、早期退職を余儀なくされた。
ジライヤ
ナルトの師匠であり、三代目火影の弟子である「伝説の三人衆」の一人で、戦いの中でヒドゥンレインのサラマンダーの半蔵を生き延びたことで悪名を馳せた。妙武山の道から賢者の術を学び、長老から弟子が世界の救世主になると言われたことから「ガマの賢者」とも呼ばれ、ベストセラーとなった大人向け恋愛小説の著者であることからナルトからは「変態の賢者」とも呼ばれています。また、ナルトが主人公の名前を冠した大作「肝っ玉かなめ」も書いている。第1部ではナルトを弟子にしていたが、第2部ではナルトを残してアカツキを調査し、かつての弟子である長門がアカツキを率いていることを知る。自来也は、ナルトがニワトリガエルの予言の子供であると信じて、長門に対抗するチャンスを隠し葉に与えるためのメッセージを送っている最中に戦死した。
北条
火影」とは、木ノ葉隠れのリーダーのことで、シリーズを通して7人が登場し、その肖像は木ノ葉隠れを見下ろす岩盤に刻まれている。
- 初代火影である柱間千住は、木ノ葉隠れの共同創設者であり、千住一族の元首であった。幼少期に戦国時代を体験した柱間は、戦国時代を終わらせたいと考え、若者に敵対視される前に内場真陀羅と友情を育んだ。柱間はマダラを説得し、鴻巣を見つけながら両家の和睦を図った。柱間はその後死亡し、シリーズを通して2度、オロチ丸によって生き返らされた。
- 二代目法華経の飛良間千住は、柱間の弟であり、蛭子猿飛の師匠である。蛭子猿飛は、影のクローンの術や、問題となった「蘇生の術」など、様々な術を駆使して隠し葉の基盤を作った法華経と言われているが、結局、オロチマルにやられてしまった。
- 三代目火影の蒜山猿飛（ひるぜんさるとび）は、シリーズで初めて登場した火影である。シリーズを通して後進の指導に当たり、当初からナルトを人として扱っていた数少ない人物の一人である。伝説の三人衆の師匠でもあり、死神の死印を使って自分と三人の先代の魂を死神の胃袋に閉じ込め、オロチ丸の魂の一部と一緒に道を踏み外した弟子に殺された。第四次世界大戦中、サスケが「うちは一族の大虐殺」の事実を確認するために、オロチマルは死印からヒルゼンの魂を解放し、ヒルゼンを生き返らせた。復活した他の火影とともにオビトやマダラとの戦いに参加したが、カグヤの敗北により安らかな眠りについた。
- 四代目火影である波風ミナトは、うずまきナルトの父親であり、カカシの師匠であり、飛雷神のテレポーテーション術を完成させた自来也の弟子でもある。シリーズ開始前、トビとの戦いの後、ミナトは蔵馬の陰のチャクラを吸い取り、獣を弱らせてナルトの体に封じ込め、息子だけが九尾の陽のチャクラにアクセスできるようにするための犠牲的な行為を行った。数年後、オロチ丸によって九尾の神通力として蘇ったミナトは、ナルトと再会し、最終的に九尾の陰のチャクラを息子に移してあの世へと帰っていった。
- 五代法師である綱手は、シリーズのほとんどで法師を務めている。三代法師の姿であり、祖父の柱間から千住家の一員となった綱手は、超人的な力を持ち、変身術を使って若々しい姿を維持している。綱手は当初、弟の縄木と恋人の加藤団がその夢のために亡くなったため、火影との関わりを持ちたくなかった。しかし、うずまきナルトとの出会いで信念を取り戻し、サクラとイノーに技術を伝授しながら火影になる。シリーズ終盤では、第四次大戦の終わりに綱手が引退し、カカシに火影の座を譲る。
志村団蔵
隠れ里の住人で、村の治安を守る秘密組織「財団」のリーダーであり、「火影」になることを目標としている。蒜山とその後継者たちを弱者と見なし、内海虐殺事件を引き起こしたり、オロチマルに協力して自分の右腕に複数のシェアリングアイと柱間の細胞を移植させたりしている。綱手の昏睡中に六代目火影候補代行に任命されたものの、サスケに致命傷を負わされ、第四次大戦時には財団が解散してしまう。
アンタゴニスト
ざぶざぶももち
ナルトの最初の敵の一人で、特に大きな刀を使う忍者集団「霧の七人衆」の元メンバー。卒業式でクラス全員を惨殺したことで有名で、血中の鉄分を吸収して自己修復する大剣「死刑執行人の剣」を持っている。四代目水影のクーデターが失敗した後、ザブザブと弟子のハクは悪党となり、ガトーという犯罪者に雇われて次のクーデターの資金調達のために傭兵として暗殺を行う。しかし、チーム7と出会い、ガトーに裏切られたザブザブは、第四次大戦時にカブトによってハクとともに生き返らされ、命を落とすことになる。
オロチマル
第1部の主役である犯罪者。蒜山（ひるぜん）の教え子で、以前は暁（あかつき）に所属し、団蔵（だんぞう）と結託していた。不老不死であらゆる術を身につけたいと願うオロチマルは、仲間の忍者を使って実験を行い、自らの研究室として忍びの里「潜伏音の里」を設立し、コノハを滅ぼすための軍団を集めた。彼の不死身の術は、数年ごとに自分の意識を別の宿主に移すというもので、シリーズのほとんどの期間、サスケ・ウチハの体を手に入れようとすることが彼の動機となっている。第二部終了後、大和の監視下に置かれたオロチマルは、ミツキを作りながら、個人的には葉隠の里との戦いを放棄した。
カブト薬師
カブトはオロチ丸の右腕であり、細胞を操作できるほどの医療忍術に長けたスパイである。カブトは当初、過去の記憶を持たない財団に潜入していたが、ダンゾウに危険視されてオロチマルに引き取られ、オロチマルに代わって様々なグループの情報を収集した。カブトは、オロチマルを倒した後、自分の運命を切り開くことを決意し、オロチマルの遺体の一部とサウンドファイブ、ジュウゴ、スイゲツ、カリンのDNAを自分の体に組み込み、蛇聖の術を習得する。カブトはまた、再誕の術を完成させ、表面の代償としてサスケを使ってトビとの同盟を強要する。しかし、カブトは敗北してしまい、サスケを救うことを決意して自分の人生の選択を見つめなおす。戦後、葉隠の監視下に置かれていたカブトは、子供の頃に監禁されていた孤児院を、養子の兄・漆とともに経営するようになる。
イタチ・ウチハ
一族を惨殺した後に暁に入隊した、悪役として描かれていた隠れ蓑の忍者。しかし死後、板東は隠れ里に忠誠を誓っており、ダンゾウの命令でクーデターを起こそうとした一族を、トビの協力を得て殺しただけだと判明する。サスケに自分を殺させるつもりだった板東は、サスケを助命することを条件に任務を引き受ける。暁のメンバーだった頃は、木曾とコンビを組んでいたこともあり、密かに暁を監視することで隠密への忠誠心を保っていた。
アカツキ
自来也の弟子である弥彦、長門、小南の3人で結成された「暁」は、「ヒドゥンレイン」の平和維持団体であったが、ダンゾウが仕組んだ悲劇により、トビが不正な忍者を雇った傭兵として再出発させたものである。長門をリーダーとするアカツキは、真の平和のために皆に苦しみを理解させることを目的とし、マダラのプロジェクト「月の目」に基づいて、尾獣をゲド像に食べさせ、全人類を服従させるために「無限の月読」を行う。
- 長門は、幼い頃にマダラの目を移植されたペインという別名で主に知られており、アカツキの頭目であり、小南のパートナーでもある。痛み」とは、長門の友人である弥彦の遺体であり、戦災孤児であった小南と共にアカツキの創設者であり、自来也から忍術を学んだ人物でもあるのだ。弥彦の死により廃人となった長門は、6つの改造された死体「六道の辻」を代理人として使い、それぞれが自分の6分の1の力を使う。自来也を殺した後、長門はナルトと一緒に隠し葉への攻撃を指揮し、ナルトは六道を倒して自来也の教えに対する長門の信頼を回復させ、マダラの復活のために飛が用意した術を使うために自らを犠牲にした。その後、トビは長門の眠る場所を冒涜してリンネガンを手に入れたが、マダラは後にそれを取り戻し、カブトは第四次大戦時に長門を生き返らせた後、イタチに封印された。
- アカツキ唯一の女性隊員で、長門の幼なじみ。自来也に師事していた小南は、持ち前の折り紙の才能を活かした戦い方を身につけていた。長門の死後、小南はアカツキから身を引き、その後、リンネガンの目を狙ってきたトビと戦うが、自爆攻撃に失敗して命を落とした。
- 霧の七人の剣士の一人である星垣如雨は、「シャークスキン」と呼ばれる生きた鱗のような剣を使い、相手のチャクラを吸収し、それを如雨に伝えることで攻撃力を高める。霧の七人の剣士の一人であり、シャークスキンと呼ばれる生きた鱗の剣を使い、相手のチャクラを無限に吸収し、そのチャクラをキサメに移して無限のスタミナを得る。嘘のない世界を見たい」という理由でアカツキに入隊し、後にキラービーを追うが、任務が潜入に変更され、ジンチャリキーの居場所をトビに送る際に捕まって自殺している。
- 毒を作る能力に長けていることから「赤砂のサソリ」と呼ばれる隠れ砂の人形忍者。カカシの父である畑作夫に両親を殺され、祖母の千代に育てられた佐曽利は、永遠に残るものを作りたいという執着心から、人間の死体を人形に変えて、その能力を生前に使えるようにする手段を開発した。村を出て、三代目風影を拉致し、砂鉄に毒を塗って主武器にした。その後、自分の体を人形に変えて、鎧兜の人形「蛭子」の中に隠し、実質的に死なないようにしながら、何百もの人形を一度に操るようになった。アカツキに加わったサソリは、オロチマル、そしてデイダラと組んで、ワンテールを取り出すために我愛羅を捕らえた。しかし、佐曽利は殺され、その人形の体は勘九郎に利用されてしまう。
- 隠れ石の忍者であるデイダラは、粘土爆弾を使ったテロリストの雇われ人として生計を立てていたが、イタチ・ウチハに強制的にアカツキに参加させられた。佐曽利、飛のパートナーとしてアカツキを受け入れていたが、作品を見下すようなシェアリングの目を感じていたことから、ウチハ一族全般に恨みを抱いていた。我愛羅の捕縛と三匹の尻尾の捕獲に一役買った後、デイダラはサスケと戦い、最後に相手を殺そうとして自爆してしまう。その後、第四次大戦時にカブトによって生き返らされた後、勘九郎に倒される。
- 隠れ湯の里に住むサドマゾのルージュ・ニンジャで、大鎌を持っており、カクズとパートナーを組んでいる。死の教団「蛇神の道」のメンバーであり、自分に致命傷を与えることで相手を殺害する儀式の技術を身につけながら、不老不死の体となった。浅間山を殺害した後、シカマルの敵となり、最後はバラバラにされて奈良家の森に埋葬された。
- 隠し滝村の忍者であり、HIDANのパートナーであるKAKUZU。初代火影の時代に生きていたカクズは、黒い脅威で体をつなぎ、最大5つの心臓を同化させて無期限に延命させる禁断の術を習得した。欲のためにアカツキの会計係や賞金稼ぎをさせられる一方で、不死身のヒダンと組むまでにパートナーの大半を殺してしまった。カクズの心臓は隠密忍者との戦いで計画的に破壊され、ナルトが最後の心臓を残した後、カカシがカクズを仕留めた。その後、カクズは第四次大戦時に生き返ってから封印される。
オビト・ウチハ
第二部の大半を占めるアカツキの真のリーダーであり、最大の敵である「トビ」。第三次世界大戦中のナルトと同様に、瀕死の状態でチームメイトのカカシに自分の左目を渡した。瀕死の状態であったにもかかわらず、マダラに助けられたオビトは、マダラがオビトの体の傷んだ部分をゼツの義肢に置き換え、弟子入りの条件を整えた。忍者はオビトの精神を崩壊させるために、渋るカカシに戦死者として野原りんの死を目撃させた。尾獣を使って現実を破壊し、理想郷を作ることができると考えたオビトは、マダラの名を継いで、かつての師であるミナトへの恨みから、現在のアカツキの誕生や九尾の隠居村への攻撃に至るまでの出来事を操作した。オビトは、右手のシェアリングランでカムイを操り、自分の姿を消して遠くへテレポートすることができるほか、柱間の細胞を持った義体として木刀で攻撃することもできる。倒された後、世界への信頼を回復し、カカシに与えたシェアリングを取り戻したオビトは、カグヤからチーム7を守るために死んだが、精神的にカカシを助けるために生還した。
マダラ ウチワ
後にサスケやナルトの前にいたインドラと阿修羅の生まれ変わりであることが判明する。戦国時代に兄弟を殺された千住を恨んでいたが、最終的には柱間の和平の申し出を受け入れたものの、自分が隠れ里に居場所がないことを悟り、幻滅してしまったという。その影響で、マダラは九尾で隠し葉を破壊しようとしたが、柱間に敗れ、死を偽装し、柱間の血でリンネガンを覚醒させ、ゲド像を召喚して延命した。マダラは最終的にオビトを代理人にして死んだ。オビトは自分の復活のために長門に輪廻を移植した。幾度かの失敗を経て復活したマダラは、自らを十尾の陣羽織に仕立て上げて計画を遂行するが、黒ゼツに裏切られ、かぐや姫の器にされてしまう。かぐや姫の再封印で解放されたものの、この試練で死の淵に立たされたマダラは、最後に柱間と和解して死んだ。
大槻かぐや
NARUTO-ナルト-』シリーズの根幹を成す敵であり、千手観音、内刃観音、日向観音などの分家を持つ異能の忍者、大筒木家の本家である。親族のように世界を食うのではなく、世界を守ることを決意したカグヤは、世界の神木の延長線上で、自分の理想とする世界平和を確立していった。しかし、神木と同化した人間を自分の白ゼツ軍に改造して親族から守るために、カグヤはやがて人間を信じられなくなり、半人前の双子の息子である羽衣と羽村がカグヤのチャクラを受け継いでいることを知り、対立することになった。カグヤは神木に合体して十尾に変身した後、羽衣に捕らえられて月に封印され、取り出したチャクラを九尾の獣に分裂させながら、死体のような戈道像に還元された。しかし、カグヤは最後の最後で黒ゼツを作り、インドラとウチワ族を使って自分の復活を画策し、最終的にマダラウチワが彼女の器となって目的を果たした。しかし、ナルトとサスケはチームの協力を得て、カグヤの体から尾獣とマダラを取り出し、カグヤを再封印することに成功する。
- 暁のスパイであり、亡くなった暁のメンバーや見つかっては困るメンバーの処分を任されている、暁の唯一の人外のメンバー。黒ゼツは、カグヤが孫のインドラとその子孫を操るために作った影のような共生体で、マダラがカグヤを解放するための手段としてリンネガンを発現させる前のものである。黒ゼツは、ゲド戦記の中で植物のようなドローン兵として同化した数千人の元人間の一人である白ゼツと結合しながら、マダラの構築物を装っていた。第四次大戦でサスケに殺された後、黒ゼツはオビト、マダラに取り付き、カグヤと共に封印された。
- オビトの外骨格となり、オビトのトビ装束の着想となった白のゼツである。第四次大戦時にはヤマトの木刀を封じ込め、マダラが「無限月読」に成功するとヤマトを脱出させた。
