極限環境生物(極限微生物)とは|高温・高圧・高塩で生きる微生物の定義と起源

極限環境生物(極限微生物)の定義から高温・高圧・高塩で生きる仕組み、起源や熱水噴出孔仮説までをわかりやすく解説。

著者: Leandro Alegsa

極限環境生物とは、地球上のほとんどの生物にとって有害な極限環境で最もよく生きる生物(生き物)のことである。中性菌好中球菌と呼ばれる通常の場所で生活する生物とは異なる。

1980年代から1990年代にかけて、生物学者は微生物が極限環境でも生存できることを発見しました。極限環境とは、ある意味で極端な環境ことです。極端に暑い、寒い、乾燥している、圧力が高い、塩分が多い、酸性であるなどです。動物や植物のような複雑な生物は、このような環境では生きられません。

地球上で生命が誕生したのは、海面下の熱水噴出孔ではないかという説がある。約39億年前アーケアン期には、高温の海や温泉、深海の熱水噴出孔などの環境があったと考えられています。初期の生命体はそのような環境で生きていたのです。

どのような環境を「極限」と呼ぶか

極限環境とは、生物にとって通常の生存域(温和な温度、通常の塩濃度、常圧、中性〜弱酸性〜弱アルカリ性のpHなど)から大きく外れる条件を指します。具体的には次のようなものがあります:

  • 高温(例:70〜120°Cの温泉や熱水噴出孔)
  • 低温(例:南極や深海の氷点近くの海水)
  • 高塩分(例:塩湖や塩田)
  • 極端なpH(強酸性や強アルカリ性の鉱山水や温泉)
  • 高圧(例:深海底)や極度の乾燥(砂漠や乾燥した岩表面)
  • 高放射線や低酸素などの特殊な化学的条件

主なタイプと代表的な例

  • 高温性(熱好性/超好熱性):温泉や深海熱水噴出孔に生息。例:Thermus属(温泉由来)、Sulfolobus(酸性熱水環境の古細菌)。
  • 低温性(低温好/陰圧性):南極や北極、深海の冷水に適応した微生物や藻類。
  • 高塩性(好塩性):塩湖や塩田に生息。Halobacteriumなどの古細菌が有名。
  • 酸性好性/アルカリ好性:pHが非常に低い鉱山排水や酸性温泉、逆に高pHのソーダ湖などに棲む生物。
  • 高圧性(耐圧性/圧力好性):深海底に適応した微生物や大型生物。
  • 乾燥耐性(耐放射線性や耐乾燥性):乾燥地帯や放射線環境で生きる微生物。例:放線菌や一部の古細菌。

生存のための仕組み(適応メカニズム)

極限環境生物は、その環境に応じた分子・細胞レベルの適応を持ちます。代表的な例:

  • タンパク質や酵素の耐熱・耐寒性:アミノ酸配列や立体構造の違い、より強い疎水性相互作用や塩橋の増加などによって安定化している。
  • シャペロンタンパク質の活性化:タンパク質の折りたたみを助け、変性から回復させる。
  • 膜脂質の組成変化:高温では飽和脂肪酸を増やして安定化、低温では不飽和脂肪酸を増やして流動性を保つ。古細菌はエーテル結合や環状脂質で極端条件に耐える。
  • 共存質(compatible solutes)の蓄積:塩ストレスや乾燥に対してグリセロール、ソルビトール、トレハロースなどを内部にためて浸透圧を調整する。
  • 修復機構の強化:DNA損傷の修復や抗酸化酵素の活性化によって放射線や酸化ストレスに耐える。
  • 代謝経路の多様化:酸素が乏しい環境でも硫黄や鉄、メタンなどをエネルギー源として利用する例がある。

極限環境生物の重要性と応用

  • 進化・起源研究:初期生命は極端な環境に適応していた可能性があり、極限環境生物の研究は生命の起源や進化を理解する手がかりになる。
  • バイオテクノロジー:耐熱酵素(例:Taqポリメラーゼ)はPCRなどの分子生物学技術に不可欠。耐塩性・耐酸性酵素や代謝経路は工業プロセスでの応用が期待される。
  • 環境・資源利用:極限微生物による鉱山排水のバイオレメディエーション(生物学的処理)や極限条件下でのバイオ燃料生産など。
  • 天体生物学(アストロバイオロジー):火星や木星・土星の衛星など地球外環境で生命が存在する可能性の評価に重要。極端条件で生きる微生物は地球外生命のモデルとなる。

研究方法と発見の歴史

極限環境生物は1970〜90年代にかけて顕著に注目され、深海探査や熱水噴出孔の発見、塩湖や極地調査によって多くの新種が報告されました。研究手法には:

  • 現地採取(深海ロボット、ボーリング、温泉や塩湖のサンプリング)
  • 培養実験:極限条件を模した培地での増殖試験(ただし多くの微生物は培養が難しい)
  • メタゲノム解析:環境試料から直接DNAを解析して微生物群集を同定・機能推定する手法
  • タンパク質解析・構造生物学:耐性を支える分子の解析

極限環境生物と地球初期の生命

冒頭で触れたとおり、約39億年前のアーケアン期には高温の海や温泉、深海の熱水噴出孔などが存在したと考えられます。これらの環境は、化学エネルギー(硫化水素や還元性金属など)や触媒的な鉱物表面を供給し、生命が化学反応を利用して増殖する場を提供した可能性があります。現存する熱水噴出孔由来の微生物や古細菌は、そうした初期の生命像を検証する重要な手がかりです。

まとめ

極限環境生物は、私たちが日常で想像する生物像を超えて多様な環境に適応した生き物たちです。彼らの研究は、生命の起源や進化の理解、革新的なバイオ技術の開発、さらには地球外生命探査にまで広がる重要な分野です。

イエローストーン国立公園のグランド・プリズマティック・スプリングの鮮やかな色は、好熱菌が作り出している。Zoom
イエローストーン国立公園のグランド・プリズマティック・スプリングの鮮やかな色は、好熱菌が作り出している。

極限環境微生物の種類

極限環境生物として知られているのは、ほとんどが微生物です。古細菌というドメインにはよく知られた好極限性生物の例があるが、バクテリアにも好極限性生物がいる。古細菌の中には中温性のものもあるので、すべての古細菌に好極限性という言葉を使うのは間違いである。また、すべての好極限生物が単細胞であるわけではなく、極限環境には細胞の動物も存在します。

極限環境生物の中には、いくつかのカテゴリーに分類されるものがある。例えば、地中深くの高温の岩石の中に生息する生物は、好熱性好気性の両方を持っています。

好酸性物質

pH3以下の環境で最もよく成長する生物。

アルカリフイルズ

pH9以上の環境で最もよく成長する生物

エンドリス

地中深くの地下水で満たされた岩石、割れ目、帯水層、断層などの中の微細な空間に生息する生物のこと。

Halophiles

高濃度の塩を必要とする生物のこと。

超好熱菌

深海の熱水噴出孔のように、80~122℃の温度で良好に生活できる生物のこと。

ハイポリス

寒い砂漠の岩の中に生息する生物。

リトホートロフト(Lithoautotrophs

二酸化炭素と無機物の酸化からしか炭素を得られない生物(通常はバクテリア)のこと。Nitrosomonas europaeaなどのケモリソトロフィーである。鉄鉱石などの鉱物化合物からエネルギーを得ている生物。これらの生物は、地球化学的な循環や、岩盤をすり減らして土壌を形成する際に作用する。

耐メタル性

これらの生物は、カドミウムヒ素亜鉛などの溶存重金属が溶液中に多く含まれていても害を受けない。

寡占化

養分がほとんどない環境でも成長できる生物。

オズモフィル

糖分を多く含む環境で生育できる生物。

ピエゾフィル

地表の奥や深海の海溝など、高い圧力下で最もよく生きる生物のこと。

ポリエクストリーム・ファン

極限環境生物の中でも、複数のカテゴリーに属する生物のこと。

サイコパス/クライオパス

15℃以下の温度でよく育つ生物のこと。冷たい土壌、永久凍土、極地の氷、冷たい海水、高山の雪の下などに多く生息している。

耐放射線性

高レベルの電離放射線を受けても生きられる生物。通常は紫外線を指すが、ガンマ線による損傷を修復できる生物もいる。

サーモフィル

60~80℃の温度でよく生きることができる生物。

熱帯雨林

好熱性と好酸性を併せ持つ生物のこと。温度70~80℃、pH2~3で最もよく成長する。

ゼロフィリア

アタカマ砂漠のような極端に乾燥した場所でも育つことができる生物。

質問と回答

Q: 好極性生物とは何ですか?


A: 好極限生物とは、地球上のほとんどの生物にとって有害な極限環境において繁栄する生物のことを指します。

Q: 好極性生物は他の生物とどう違うのですか?


A: 好極性生物は、中好性生物または好中性生物と呼ばれる、通常の場所に生息する他の生物とは異なります。

Q: 生物学者が、微生物が極限環境でも生存できることを発見したのはいつですか?


A: 1980年代から1990年代にかけて、微生物が極限環境でも生存できることが発見されました。

Q:微生物が生存できる極限環境にはどのような例がありますか?


A:極端な高温、低温、乾燥、高圧、塩分や酸性の環境などです。

Q: 動物や植物のような複雑な生物は、なぜ極限環境では生きられないのでしょうか?


A: 動物や植物のような複雑な生物は、そのような環境で生き残るための適応がないため、極端な環境では生きられません。

Q: 地球上で生命が誕生した可能性を示唆する科学者がいますが、それはどこですか?


A: 地球上の生命は、海面下の熱水噴出孔で誕生した可能性があるとする研究者がいます。

Q: 熱い海、温泉、深海の熱水噴出孔などの環境はいつごろからあったのでしょうか?


A: 熱い海や温泉、深海の熱水噴出孔などの環境は、約39億年前の古生代に存在していたと考えられています。


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