アメリカン航空11便の機体はボーイング767型機だった。158人の乗客を乗せることができたにもかかわらず、9月11日のフライトでは81人の乗客と11人の乗員しか乗れませんでした。搭乗したのはパイロットのジョン・オゴノウスキーと一等航海士のトーマス・マクギネス。客室乗務員は、バーバラ・アレステグイ、ジェフリー・コルマン、サラ・ロー、カレン・マーティン、キャスリーン・ニコシア、ベティ・オング、ジーン・ロジャー、ダイアン・スナイダー、マデリン・スウィーニーであった。
搭乗
テロリスト集団アルカイダのメンバーでテロ攻撃のリーダーであるモハメド・アッタと、もう一人のハイジャック犯アブドゥルアジズ・アル・オマリは、２００１年９月１１日の早朝、メイン州ポートランドからボストンに向けて飛び立ちました。両者ともカリフォルニア州ロサンゼルス行きのファーストクラスの航空券を持っていました。他の3人のハイジャック犯、ワリード・アル・シェフリ、ワイル・アル・シェフリ、サタム・アル・スーカミは車でローガン国際空港に到着した。5人全員がチェックインを済ませ、07:40には07:45に出発するはずだった飛行機に乗り込んだ。
モハメド・アッタはビジネスクラスでアブドゥルアジズ・アル・オマリ、スカミと一緒に座った。ワリード・アル・シェフリとワイル・アル・シェフリはファーストクラスに座った。航空機は26番ゲートからタキシングを行い、14分の遅延の後、7時59分にローガン国際空港を滑走路4Rから出発した。
ハイジャック
飛行機のハイジャックが始まったのは08:14と考えられています。パイロットと副官がボストンの航空管制官との会話をやめた時のことです。その2分後、機体は予定されていたルートを飛行しなくなった。機体からはそれ以上の無線応答はなく、他の航空機への衝突を避けるために使用されていた機体内のシステムもオフになっていた。客室乗務員のオングとスウィーニーは、ハイジャック中にAT&Tの公衆電話でアメリカン航空に連絡を取った。彼らによると、ハイジャック犯は他の客室乗務員のうち2人を負傷させ、イスラエル人の乗客を殺害したという。4分間の長い通話の間、オング氏はハイジャック犯がどの席に座っていたかを航空会社に伝え、誰もコックピットに入ることはできないと述べました。
08:23:38、アッタはコックピットから乗客と話そうとしたが、間違ったボタンを押してしまい、航空管制にメッセージを送ってしまった。彼は「[彼らは]いくつかの飛行機を持っています、静かにしていれば大丈夫です。空港に戻ります」と言った。1分後には「誰も動くな。すべては大丈夫だ。動こうとすると、自分自身と飛行機を危険にさらすことになる。静かにしていてくれ"航空管制官は航空機がハイジャックされたことに気付き連邦航空局に連絡しました。すぐにアッタは発表しました "誰も動かないでください 空港に戻ります バカな動きはしないでください"その５分後 ボストン航空管制局は 北米航空宇宙防衛司令部（NORAD）に連絡しましたノース・アメリカ航空宇宙防衛司令部（NORAD）は2機のF-15戦闘機にフライトのキャッチを命じたが、時すでに遅し、AA11はマンハッタンに向けて最終旋回を行い、戦闘機が離陸する6分以上前に世界貿易センターのノースタワーに墜落していた。
クラッシュ
午前8時46分40秒、ハイジャック犯は11便を世界貿易センターのノースタワー（タワー1）の北側に墜落させました。時速750キロで飛行し、約1万ガロンの可燃性燃料を積んだこの飛行機は、ノースタワーの93階と99階の間に墜落しました。乗員92人が死亡しました。
ノースタワーの被害が大きかったため、航空機が墜落した場所の上から脱出することができませんでした。92階から上の階段とエレベーターはすべて封鎖され、1,344人が閉じ込められました。数百人が衝撃で即死しました。残りの数百人は、火災と煙、またはタワーの崩壊により、閉じ込められて死亡した。何人かはビルから飛び降りて死んだ。つ以上のエレベーターシャフトが燃える燃料を下に運び、下に降りる途中で爆発した。
フランス人カメラマンのジュール・ナウデが墜落の様子を撮影した。ブルックリンの美術展に設置された4秒ごとのローワー・マンハッタンを撮影するウェブカメラでは、ノースタワーに墜落する11便の様子も撮影されていました。
世界貿易センターでの爆発が報道されました。CNNは8時49分にコマーシャルを中断して"ワールド・トレード・センター災害"との見出しを出したブッシュ大統領はフロリダ州サラソタの小学校に到着中、墜落事故を知らされた。大統領は「これはパイロットのミスだ。誰かがこんなことをするなんて信じられない。心臓発作を起こしたに違いない」と述べた。最初の報道では、９時３分に１７５便がサウスタワーに墜落するまでは、墜落は事故ではないかと思われていた。
